RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF14Q9UBS8 474 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D29Q9UFV1 150 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0U1RQS6 177 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC78A2IDD5 438 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MROH6A6NGR9 719 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF839A8K0R7 811 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 EFCAB7A8K855 629 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 AURKAO14965 403 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 B4GAT1O43505 415 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MTX2O75431 263 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFS3O75489 264 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FUCA1P04066 466 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 APOA4P06727 396 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 THRAP10827 490 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MLNP12872 115 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 GP1BBP13224 206 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TPSB2P20231 275 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ITPKBP27987 946 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CHRNA4P43681 627 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FNTAP49354 379 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PRLHRP49683 370 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CXADRP78310 365 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TMPRSS15P98073 1019 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TLE3Q04726 772 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 VAC14Q08AM6 782 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SPARCL1Q14515 664 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRRQ15256 657 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R7Q15435 360 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TPSAB1Q15661 275 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KCTD11Q693B1 232 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 IRGCQ6NXR0 463 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CASC4Q6P4E1 433 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PACS1Q6VY07 963 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS42Q7Z5A4 293 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP206Q8IYR0 622 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ESX1Q8N693 406 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4L1Q8NH43 312 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf54Q8WWF1 131 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LCN9Q8WX39 176 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 USP7Q93009 1102 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SGF29Q96ES7 293 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SGSM3Q96HU1 749 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf66Q96MD2 445 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CATSPER2Q96P56 530 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF12Q99081 682 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf62Q9BQA9 187 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 APOL2Q9BQE5 337 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NAT9Q9BTE0 207 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PDP2Q9P2J9 529 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM10Q9UDY6 481 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RABGEF1Q9UJ41 708 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KCND3Q9UK17 655 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRK2Q5S007 2527 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms