RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 NRROSQ86YC3 692 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ISL2Q96A47 359 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SKA1Q96BD8 255 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 LINGO1Q96FE5 620 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TLK1Q9UKI8 766 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEC1O60732 1142 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPAN12O95859 305 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CRABP2P29373 138 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 OXR1Q8N573 874 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 EPN2O95208 641 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSEP14091 401 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTR1BP42025 376 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GLRBP48167 497 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTR1AP61163 376 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 BNIP3Q12983 259 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 HM13Q8TCT9 377 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 LMX1AQ8TE12 382 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 NXNL1Q96CM4 212 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN10Q9HC96 672 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ACOT9Q9Y305 439 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GPC4O75487 556 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 APOA4P06727 396 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ABRQ12979 859 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM159Q96B96 161 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SHBQ15464 509 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 HLA-BQ31612 363 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT87PA6NCN2 255 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 F8W8V4 182 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 OPA1O60313 960 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CLCNKAP51800 687 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 IL2P60568 153 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC3Q13217 504 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 METRNLQ641Q3 311 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf46Q6P387 395 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CROCCP2Q86T23 111 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB14O43829 449 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SLCO2B1O94956 709 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 MPOP05164 745 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CD9P21926 228 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TLCD1Q96CP7 247 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 LOXL4Q96JB6 756 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PRRX2Q99811 253 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 WWP1Q9H0M0 922 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BQF6 201 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC7O00311 574 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 BRAFP15056 766 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXD12P35452 270 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 BLKP51451 505 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 GBX1Q14549 363 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP76Q8TAP6 659 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PATE1Q8WXA2 126 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.25■■□□□ 1.15
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