RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511947.2

AP001790.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP001790.1, Length 570 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001790.1-201ENST00000511947 SGSM3Q96HU1 749 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 SYBUQ9NX95 663 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 PDP2Q9P2J9 529 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 KLHL3Q9UH77 587 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.67□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 OR1I1O60431 355 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 OR56A5P0C7T3 313 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CCL4P13236 92 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 NMBRP28336 390 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 SLC5A2P31639 672 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ABCG1P45844 678 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 KLHL35Q6PF15 583 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM129CQ86XR2 697 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 TGM7Q96PF1 710 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 KIFC1Q9BW19 673 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 COG4Q9H9E3 785 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 TREX1Q9NSU2 369 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 OGFRQ9NZT2 677 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.66□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 TMEM63AO94886 807 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 VAPBO95292 243 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 MLNP12872 115 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 PAMP19021 973 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ITPKBP27987 946 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 NDUFS1P28331 727 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ETV5P41161 510 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 PAFAH1B1P43034 410 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CAPZBP47756 277 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 PREPP48147 710 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 TTPAP49638 278 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 RPA4Q13156 261 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 SYTL3Q4VX76 610 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ARMC3Q5W041 872 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CES3Q6UWW8 571 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 XKR5Q6UX68 686 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 CREG2Q8IUH2 290 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 MCUQ8NE86 351 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ELMO1Q92556 727 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 RSC1A1Q92681 617 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 USP7Q93009 1102 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 MFSD3Q96ES6 412 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 SOX13Q9UN79 622 aa14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AP001790.1-201ENST00000511947 MAGEB16A2A368 324 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 EFCAB7A8K855 629 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 KLK10O43240 276 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 PRAMEF10O60809 474 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 RASSF9O75901 435 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 PDHA2P29803 388 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 GFERP55789 205 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 SEMA3AQ14563 771 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 BRD3Q15059 726 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 IRGCQ6NXR0 463 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
AP001790.1-201ENST00000511947 MPP5Q8N3R9 675 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms