RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CNIH4Q9P003 139 aa2.23□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC24A2Q9UI40 661 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TESMINQ9Y4I5 508 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 NAIPQ13075 1403 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 WIPF3A6NGB9 483 aa2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 STAM2O75886 525 aa2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 C8orf89P0DMQ9 161 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ENGP17813 658 aa2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 PQLC2Q6ZP29 291 aa2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 RBFAQ8N0V3 343 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB2Q8N680 514 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 EGLN2Q96KS0 407 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 LPIN1Q14693 890 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SLC39A12Q504Y0 691 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 LRIF1Q5T3J3 769 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 NHLRC1Q6VVB1 395 aa2.22□□□□□ -2.05
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