RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 LCA5Q86VQ0 697 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 DCLK2Q8N568 766 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 GPR21Q99679 349 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 EDEM2Q9BV94 578 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 KCNK6Q9Y257 313 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 KNL1Q8NG31 2342 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 A0A0G2JNG1 304 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CCDC189A1A4V9 331 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PATE3B3GLJ2 98 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 OPA1O60313 960 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 MT-ND3P03897 115 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SHBGP04278 402 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 GABRB3P28472 473 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CA5AP35218 305 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLCO1A2P46721 670 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 IRX4P78413 519 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SPEM2Q0P670 501 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 KRT33BQ14525 404 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 KIR2DS5Q14953 304 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 METRNLQ641Q3 311 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 KRT222Q8N1A0 295 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PHC3Q8NDX5 983 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TBK1Q9UHD2 729 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ACOT9Q9Y305 439 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 LNP1A1A4G5 178 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SCAMP1O15126 338 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 FLRT2O43155 660 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SGTAO43765 313 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SNX2O60749 519 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PIAS1O75925 651 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 MPC1LP0DKB6 136 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 F3P13726 295 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CCR7P32248 378 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CCNFP41002 786 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ABCG1P45844 678 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CLCN7P51798 805 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ATP6V0D1P61421 351 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 NHLH1Q02575 133 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SP140Q13342 867 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 BMPR2Q13873 1038 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 NFE2L1Q14494 772 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PDZD3Q86UT5 571 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CD200R1Q8TD46 325 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ANKRD7Q92527 254 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZIM3Q96PE6 472 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CENPHQ9H3R5 247 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SNX15Q9NRS6 342 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 BPTFQ12830 3046 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms