RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BTN3A1	O00481	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ECI2	O75521	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHRM3	P20309	590 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM47B	Q8NA70	645 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDK15	Q96Q40	435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HBEGF	Q99075	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1B0GVM2	712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CSF2RA	P15509	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HK2	P52789	917 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PSME3	P61289	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PON2	Q15165	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ILVBL	A1L0T0	632 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IDH3B	O43837	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLIC3	O95833	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BCL10	O95999	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CD247	P20963	164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRMT2	P55345	433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYP4F8	P98187	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIF19	Q2TAC6	998 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUDT8	Q8WV74	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FIG4	Q92562	907 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF558	Q96NG5	402 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ACOX2	Q99424	681 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CES1	P23141	567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ME2	P23368	584 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CSK	P41240	450 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	JADE3	Q92613	823 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NR5A2	O00482	541 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BNIP3L	O60238	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATE1	O95260	518 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HK3	P52790	923 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDKL1	Q00532	357 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PKP2	Q99959	881 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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