RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 MT-ND2P03891 347 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 S100BP04271 92 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ERVK-8P63133 956 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 NPTX1Q15818 432 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 XKR7Q5GH72 579 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB41Q5JT25 222 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ELMO1Q92556 727 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM162AQ96A26 154 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 BRINP2Q9C0B6 783 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 DSN1Q9H410 356 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 RIBC2Q9H4K1 309 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ELP3Q9H9T3 547 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJB9Q9UBS3 223 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PTGESO14684 152 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 GABRDO14764 452 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 SNPHO15079 494 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 CHEK2O96017 543 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 MMP2P08253 660 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 SERPINB10P48595 397 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 NEK2P51955 445 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 LRIT3Q3SXY7 679 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 GTDC1Q4AE62 458 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF691Q5VV52 312 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 HMCESQ96FZ2 354 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF599Q96NL3 588 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 CLSTN3Q9BQT9 956 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ACTL8Q9H568 366 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 TTC3P53804 2025 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 MROH6A6NGR9 719 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 KERAO60938 352 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS4BO75351 444 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 DCTP40126 519 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC26A3P40879 764 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF33AQ06730 810 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf131Q5VYM1 1079 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZSR9 355 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 DET1Q7L5Y6 550 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 PLD3Q8IV08 490 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 PPTC7Q8NI37 304 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 MYLPFQ96A32 169 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 GAD1Q99259 594 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 VNN3Q9NY84 501 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 IPPQ9Y573 584 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD34BA5PLL1 514 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 E9PAM4 449 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 ARVCFO00192 962 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 KATNA1O75449 491 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 LCKP06239 509 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 EPS8Q12929 822 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 GRIK2Q13002 908 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 CLCA4Q14CN2 919 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 NR6A1Q15406 480 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 SYT16Q17RD7 645 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 STEAP3Q658P3 488 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 SPATC1Q76KD6 591 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 LYSMD2Q8IV50 215 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 C3orf58Q8NDZ4 430 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 RHOXF1Q8NHV9 184 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 MCFD2Q8NI22 146 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 STAG3L4Q8TBR4 150 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2FQ969M7 185 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 PYCR2Q96C36 320 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 YIPF6Q96EC8 236 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 WDR70Q9NW82 654 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 USE1Q9NZ43 259 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 C3orf18Q9UK00 162 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms