RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SMSP52788 366 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RRADP55042 308 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CSNK1G2P78368 415 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 Q0VFX4 171 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC12A1Q13621 1099 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SURF1Q15526 300 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DLG2Q15700 870 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ALG11Q2TAA5 492 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FSCBQ5H9T9 825 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 EFHC1Q5JVL4 640 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM71Q6P5X7 295 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SYVN1Q86TM6 617 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR49Q8IV35 697 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 UNC45BQ8IWX7 931 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PQLC1Q8N2U9 271 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF152Q8N8N0 203 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMIEQ8NEW7 156 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT10Q8NFP7 164 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5B17Q8NGF7 314 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GRHL3Q8TE85 626 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FNIP1Q8TF40 1166 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF139Q8WU17 664 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FAR1Q8WVX9 515 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT11Q96G61 164 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 AGAP3Q96P47 875 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 REEP2Q9BRK0 252 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR87Q9BY21 358 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ENKD1Q9H0I2 346 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZHX3Q9H4I2 956 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 WDCPQ9H6R7 721 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 LANCL2Q9NS86 450 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PNPOQ9NVS9 261 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM53CQ9NYF3 392 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KLQ9UEF7 1012 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PADI1Q9ULC6 663 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 EXOC7Q9UPT5 735 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC13O75165 2243 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCA1O95477 2261 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGA8IPA6NC78 632 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 A8MU76 341 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 STX6O43752 255 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ACSL4O60488 711 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PRAMEF4O60810 478 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TBCAO75347 108 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 JRKO75564 520 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ITGA10O75578 1167 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM63AO94886 807 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 REC8O95072 547 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 LY6G6DO95868 133 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GYPEP15421 78 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS6KB1P23443 525 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPN4P29074 926 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ATICP31939 592 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 LIMS1P48059 325 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NUMBP49757 651 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PEX5P50542 639 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF131P52739 623 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC12A3P55017 1021 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CTXN1P60606 82 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 HGFACQ04756 655 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RUNX1T1Q06455 604 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 STK3Q13188 491 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SP140Q13342 867 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPC3Q13507 836 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PCOLCEQ15113 449 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KYNUQ16719 465 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GAGE13Q4V321 117 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 VWA3BQ502W6 1294 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.99□□□□□ -1.77
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