RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445497.1

UBBP3-201, Transcript of ubiquitin B pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene UBBP3, Length 241 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP3-201ENST00000445497 TGM4P49221 684 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SLC26A2P50443 739 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 BCAP31P51572 246 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PRKAG1P54619 331 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 EMP2P54851 167 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 EMP3P54852 163 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 UCP2P55851 309 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SPCS3P61009 180 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 RPS15P62841 145 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TNNC1P63316 161 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 MXRA7P84157 204 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 XIAPP98170 497 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CDC42EP1Q00587 391 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GHRHRQ02643 423 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CHRNB3Q05901 458 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 KLC1Q07866 573 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 POU4F2Q12837 409 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CDH17Q12864 832 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TSPAN31Q12999 210 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SLC13A2Q13183 592 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 NAE1Q13564 534 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GRAPQ13588 217 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 IL10RAQ13651 578 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 FLOT2Q14254 428 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 RAB39AQ14964 217 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 NR1D2Q14995 579 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TMED2Q15363 201 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GPR19Q15760 415 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CHRNA2Q15822 529 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 MAN2A1Q16706 1144 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CDO1Q16878 200 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 BTBD16Q32M84 506 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 P3H1Q32P28 736 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 USP41Q3LFD5 358 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 LRRC24Q50LG9 513 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CBWD5Q5RIA9 395 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 C9orf50Q5SZB4 431 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 MARCH8Q5T0T0 291 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 MFSD14CQ5VZR4 134 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 LRRC66Q68CR7 880 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SLC9A4Q6AI14 798 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 VITQ6UXI7 678 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 FAM151BQ6UXP7 276 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 WDR88Q6ZMY6 472 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 IDO2Q6ZQW0 420 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CLEC17AQ6ZS10 378 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PAQR9Q6ZVX9 377 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 C1orf186Q6ZWK4 172 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SYT13Q7L8C5 426 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GSTA5Q7RTV2 222 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TAS1R1Q7RTX1 841 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SNX20Q7Z614 316 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CUZD1Q86UP6 607 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 ZFAND4Q86XD8 727 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PPP1R3BQ86XI6 285 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 PLD3Q8IV08 490 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 RASGRP3Q8IV61 690 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GID4Q8IVV7 300 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 ARHGEF19Q8IW93 802 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 CDK20Q8IZL9 346 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 TRAM1L1Q8N609 369 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 SLC17A8Q8NDX2 589 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 DBF4BQ8NFT6 615 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 OR8J1Q8NGP2 316 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 OR1N1Q8NGS0 311 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 BBS10Q8TAM1 723 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 OIT3Q8WWZ8 545 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 ELMO1Q92556 727 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 COPS5Q92905 334 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 MRGPRFQ96AM1 343 aa2.75□□□□□ -1.97
UBBP3-201ENST00000445497 MOAP1Q96BY2 351 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms