RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 AQP9O43315 295 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 HCRTO43612 131 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 IL18RAPO95256 599 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TBX18O95935 607 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 IL1BP01584 269 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TCN2P20062 427 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 KRT222Q8N1A0 295 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 CEP112Q8N8E3 955 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PDPRQ8NCN5 879 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TMIEQ8NEW7 156 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 EPSTI1Q96J88 318 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 TIPINQ9BVW5 301 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 COMMD8Q9NX08 183 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 RRN3Q9NYV6 651 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MYH10P35580 1976 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 D6RAR5 112 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 GPR39O43194 453 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 CDC25AP30304 524 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 IL17AQ16552 155 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MPPE1Q53F39 396 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 SPASTQ9UBP0 616 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CDC23Q9UJX2 597 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 RAB21Q9UL25 225 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 HIVEP1P15822 2718 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ESPL1Q14674 2120 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01548A6NM66 108 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 K7EM74 188 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 INPP4BO15327 924 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TP73O15350 636 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SLC7A4O43246 635 aa6.23□□□□□ -1.41
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