RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 COG4Q9H9E3 785 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 GULP1Q9UBP9 304 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDYLQ9Y232 598 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GTW7 788 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASGRP1O95267 797 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFP01375 233 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT1P04628 370 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPC1LP0DKB6 136 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITPKAP23677 461 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXD12P35452 270 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 GMPRP36959 345 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPARDQ03181 441 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA6LQ8N4H0 392 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BM21 787 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLIN3O60664 434 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACP5P13686 325 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFEBP19484 476 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLCNKAP51800 687 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 HK3P52790 923 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 C21orf59P57076 290 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NXPH1P58417 271 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPP2Q14168 576 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFE2L1Q14494 772 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 METRNLQ641Q3 311 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RABEPKQ7Z6M1 372 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ISCA2Q86U28 154 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 HID1Q8IV36 788 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RDH11Q8TC12 318 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1191Q96A73 305 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCYL1Q96KG9 808 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLC4Q9NSK0 619 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF358Q9NW07 568 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MID2Q9UJV3 735 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR19A6NJB7 356 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTN3A1O00481 513 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB14O43829 449 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROCP04070 461 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ETV4P43268 484 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLRBP48167 497 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYT12Q8IV01 421 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 VRK3Q8IV63 474 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 OGFRQ9NZT2 677 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 EMCNQ9ULC0 261 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC3AQ02505 3323 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYCE1LA8MT33 242 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC16A5O15375 505 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSF2P04141 144 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 C8GP07360 202 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 IDSP22304 550 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PREPP48147 710 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SP140Q13342 867 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TECRLQ5HYJ1 363 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf46Q6P387 395 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 XKR5Q6UX68 686 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTERQ96BW5 349 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms