RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS56P0CW18 603 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ERVK-10P10266 1014 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 GNB3P16520 340 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 EDN2P20800 178 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 OAS2P29728 719 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 BDKRB2P30411 391 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 EFNA5P52803 228 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ISL1P61371 349 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 GNG11P61952 73 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MORC3Q14149 939 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 NAA25Q14CX7 972 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 BRD3Q15059 726 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ALX1Q15699 326 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TCTN1Q2MV58 587 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TEX35Q5T0J7 233 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SPINK14Q6IE38 97 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 OLFM4Q6UX06 510 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 PDILTQ8N807 584 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 IQUBQ8NA54 791 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 NCOA7Q8NI08 942 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 PIGTQ969N2 578 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 DHX58Q96C10 678 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 CMKLR1Q99788 373 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 NUF2Q9BZD4 464 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 NOD2Q9HC29 1040 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1456Q9P272 454 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 PKD1L3Q7Z443 1732 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ZMYM6O95789 1325 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 LAMB4A4D0S4 1761 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 CPLX1O14810 134 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 GPAA1O43292 621 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 RPS6KA5O75582 802 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 HEXAP06865 529 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 HOXC8P31273 242 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 KRT9P35527 623 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TUBB2AQ13885 445 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MTF1Q14872 753 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TAF11Q15544 211 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SPECC1Q5M775 1068 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 GPAT4Q86UL3 456 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TTC5Q8N0Z6 440 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MLKLQ8NB16 471 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC191Q8NCU4 936 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MSANTD4Q8NCY6 345 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 CNNM3Q8NE01 707 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 NEK11Q8NG66 645 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 EXOC4Q96A65 974 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 PANX2Q96RD6 677 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TSPYL1Q9H0U9 437 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 RAI14Q9P0K7 980 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 PAK5Q9P286 719 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 FEM1BQ9UK73 627 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 ABCC12Q96J65 1359 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-202ENST00000368205 MEGF6O75095 1541 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTSL3P82987 1691 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRK-202ENST00000368205 ALS2Q96Q42 1657 aa3.59□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms