RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LGALS2P05162 132 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PFKMP08237 780 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MMP8P22894 467 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GLRA2P23416 452 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CDK2P24941 298 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 S100A2P29034 98 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CHKAP35790 457 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC15A1P46059 708 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GNPDA1P46926 289 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GPR33Q49SQ1 333 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OR2T12Q8NG77 320 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AIFM3Q96NN9 605 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZYG11BQ9C0D3 744 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 V9GYQ6 96 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OR6C75A6NL08 312 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TPP1O14773 563 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DCXO43602 365 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PMPCBO75439 489 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GNAO1P09471 354 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MYBP10242 640 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 COL6A1P12109 1028 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM23P36406 574 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MAP2K4P45985 399 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ1P48048 391 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TGM4P49221 684 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PPP5CP53041 499 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AP1S1P61966 158 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PIGGQ5H8A4 983 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MPP7Q5T2T1 576 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 WDR59Q6PJI9 974 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP8Q86W28 1048 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ANKFN1Q8N957 763 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PLD4Q96BZ4 506 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MBOAT7Q96N66 472 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ITPAQ9BY32 194 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACSL5Q9ULC5 683 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF831Q5JPB2 1677 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PHLPP1O60346 1717 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OR6B1O95007 311 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C9P02748 559 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 INSRRP14616 1297 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NPR2P20594 1047 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PRPS1L1P21108 318 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 USP46P62068 366 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PTSQ03393 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TLE3Q04726 772 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC18A2Q05940 514 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 USP4Q13107 963 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PCK2Q16822 640 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HID1Q8IV36 788 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KAT5Q92993 513 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA4CQ9C0C4 833 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 POMKQ9H5K3 350 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 COQ4Q9Y3A0 265 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SCN2AQ99250 2005 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DPB1P04440 258 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SELPP16109 830 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PTGER3P43115 390 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TUBP50607 506 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CYP4F2P78329 520 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CYP4F3Q08477 520 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms