RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FRS2Q8WU20 508 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PCED1BQ96HM7 432 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SMOQ99835 787 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SH3GL1Q99961 368 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SSX4O60224 188 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CST1P01037 141 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 IL12AP29459 219 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TPI1P60174 286 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZNF404Q494X3 552 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GPR158Q5T848 1215 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DDIT4Q9NX09 232 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FBXO10Q9UK96 956 aa16.58■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 H0Y626 953 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TRIM16O95361 564 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MTPNP58546 118 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 UFM1P61960 85 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 RAPSNQ13702 412 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CDK10Q15131 360 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TMEM199Q8N511 208 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FBXO30Q8TB52 745 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TBL1YQ9BQ87 522 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 EFCAB9A8MZ26 197 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GNGT2O14610 69 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MTSS1O43312 755 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ANXA6P08133 673 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ADRA1BP35368 520 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GALK2Q01415 458 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 EMX2Q04743 252 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 NKG7Q16617 165 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CEP78Q5JTW2 689 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 NT5C3BQ969T7 300 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 EGLN2Q96KS0 407 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 C3orf18Q9UK00 162 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa16.57■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 BCKDKO14874 412 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 NCAM2O15394 837 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MT-ND2P03891 347 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ITGB6P18564 788 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DNAJB2P25686 324 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TRAF3Q13114 568 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZFP69Q49AA0 526 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 KANK2Q63ZY3 851 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ISCA2Q86U28 154 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 HASPINQ8TF76 798 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FICDQ9BVA6 458 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 USE1Q9NZ43 259 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GTL3 188 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GABRDO14764 452 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FTH1P02794 183 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CD36P16671 472 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SCNN1GP51170 649 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 P2RX3P56373 397 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DAOAP59103 153 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TSPEARQ8WU66 669 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZNF566Q969W8 418 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PPM1MQ96MI6 270 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MMP27Q9H306 513 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 COMMD8Q9NX08 183 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms