RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 SBSNQ6UWP8 590 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CARNMT1Q8N4J0 409 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 PDPRQ8NCN5 879 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RNF217Q8TC41 542 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 FNDC8Q8TC99 324 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R14BQ96C90 147 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RDH12Q96NR8 316 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF711Q9Y462 761 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD12Q6UB98 2062 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 KCNH1O95259 989 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 MTPNP58546 118 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 KLHL35Q6PF15 583 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 GORASP2Q9H8Y8 452 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa27.56■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ATE1O95260 518 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 HMOX2P30519 316 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SELPLGQ14242 412 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 GPR107Q5VW38 600 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF773Q6PK81 442 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ANKS3Q6ZW76 656 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 LRRC8DQ7L1W4 858 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 TMBIM1Q969X1 311 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 UGT2B28Q9BY64 529 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 IL17CQ9P0M4 197 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 H0Y858 1186 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ALPLP05186 524 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SGSHP51688 502 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ARF5P84085 180 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 PLCL1Q15111 1095 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RTP2Q5QGT7 225 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 HECTD3Q5T447 861 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RNF165Q6ZSG1 346 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB18Q99592 522 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 TLR9Q9NR96 1032 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SMPD4Q9NXE4 827 aa27.55■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SH3PXD2BA1X283 911 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 IQCF5A8MTL0 148 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 FFAR2O15552 330 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 GJB5O95377 273 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 GLUD1P00367 558 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 THRBP10828 461 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SELPP16109 830 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 TRAF3Q13114 568 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ABRAXAS2Q15018 415 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0040Q15053 153 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 EGFL6Q8IUX8 553 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 IPPKQ9H8X2 491 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa27.54■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 NOL3O60936 208 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 KLKB1P03952 638 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ENTPD1P49961 510 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 DGKQP52824 942 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF783Q6ZMS7 281 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 MILR1Q7Z6M3 343 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 THAP11Q96EK4 314 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF583Q96ND8 569 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 MUS81Q96NY9 551 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CCL27Q9Y4X3 112 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 COCHO43405 550 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 STC2O76061 302 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 HMGCLP35914 325 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SLC11A1P49279 550 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ADGRF1Q5T601 910 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SLC13A3Q8WWT9 602 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF840PA6NDX5 716 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RGS14O43566 566 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 FKTNO75072 461 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CD160O95971 181 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 NFKBIAP25963 317 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 RGS4P49798 205 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 PRMT2P55345 433 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 EPS8Q12929 822 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 TMED1Q13445 227 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 HOMEZQ8IX15 550 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 CLEC4FQ8N1N0 589 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 OR2T12Q8NG77 320 aa27.52■■■□□ 2
UBP1-201ENST00000283628 SDCCAG3Q96C92 435 aa27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms