RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PTERQ96BW5 349 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FANCEQ9HB96 536 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 PALMDQ9NP74 551 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NIPSNAP2O75323 286 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ARRB2P32121 409 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 PNLIPRP1P54315 467 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MPPE1Q53F39 396 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FIBCD1Q8N539 461 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GIPC3Q8TF64 312 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MYDGFQ969H8 173 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NANOGQ9H9S0 305 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 PCTPQ9UKL6 214 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SOCS2O14508 198 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RFXANKO14593 260 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 BCKDKO14874 412 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CTPS1P17812 591 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SOX6P35712 828 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 HSPA7P48741 367 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GABARAPL2P60520 117 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ISOC1Q96CN7 298 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 KCNA7Q96RP8 456 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CIPCQ9C0C6 399 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CMTM6Q9NX76 183 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GALPQ9UBC7 116 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CKMP06732 381 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SBK3P0C264 359 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ITGA2P17301 1181 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CD9P21926 228 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ARNTP27540 789 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PSMB9P28065 219 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NSG1P42857 185 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ASMTP46597 345 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ST8SIA6P61647 398 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DSC3Q14574 896 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PLCL1Q15111 1095 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MOGQ16653 247 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TMBIM1Q969X1 311 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CYBAP13498 195 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A2P23975 617 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RRM2P31350 389 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HNMTP50135 292 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HLCSP50747 726 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CCR3P51677 355 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SUOXP51687 545 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 APOFQ13790 326 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TGFBIQ15582 683 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ATG9BQ674R7 924 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 LILRA2Q8N149 483 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TMEM159Q96B96 161 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 VPS4AQ9UN37 437 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OARD1Q9Y530 152 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SCN4AP35499 1836 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 C9JVG2 144 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ARNTLO00327 626 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ABCB7O75027 752 aa8.7□□□□□ -1.02
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