RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 GSC2O15499 205 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MATN4O95460 622 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C2P06681 752 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A3P35503 534 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PTPN5P54829 565 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SP2Q02086 613 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KCNA10Q16322 511 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CARD16Q5EG05 197 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RAB43Q86YS6 212 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SIX5Q8N196 739 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MCFD2Q8NI22 146 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 UFD1Q92890 307 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NUS1Q96E22 293 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C1orf109Q9NX04 203 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 IL36AQ9UHA7 158 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ARL5CA6NH57 179 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DUXAA6NLW8 204 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ITPKBP27987 946 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DGKGP49619 791 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DUSP4Q13115 394 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SEMA5AQ13591 1074 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SPIN4Q56A73 249 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RFT1Q96AA3 541 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ABCG4Q9H172 646 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PLK2Q9NYY3 685 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EMC3Q9P0I2 261 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PPM1 405 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 COQ9O75208 318 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TCEA3O75764 348 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CYB5AP00167 134 aa7.12□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 TAS2R50P59544 299 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP8P85298 464 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FUT2Q10981 343 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 IL18Q14116 193 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.12□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 TNS4Q8IZW8 715 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZNF567Q8N184 647 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 APOLD1Q96LR9 279 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FCRL5Q96RD9 977 aa7.12□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CFL2Q9Y281 166 aa7.12□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RCCD1A6NED2 376 aa7.12□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 PI15O43692 258 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZMPSTE24O75844 475 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PAX7P23759 505 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GNALP38405 381 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CASRP41180 1078 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KCNJ2P63252 427 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CYP4F3Q08477 520 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CACUL1Q86Y37 369 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 THRSPQ92748 146 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FATE1Q969F0 183 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NXNL1Q96CM4 212 aa7.12□□□□□ -1.27
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