RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 KMOO15229 486 aa15.96■□□□□ 0.15
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SPCS1-201ENST00000233025 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
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SPCS1-201ENST00000233025 CSNK1G2P78368 415 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DPYSQ14117 519 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 INAQ16352 499 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 RPE65Q16518 533 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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SPCS1-201ENST00000233025 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.92■□□□□ 0.14
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