RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225983.10

HDAC5-201, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene HDAC5, Length 5,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-201ENST00000225983 PQLC3Q8N755 202 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SKA1Q96BD8 255 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ELP6Q0PNE2 266 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 RAPSNQ13702 412 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 TRIM63Q969Q1 353 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 PTPN18Q99952 460 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ALPIP09923 528 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 UGT1A6P19224 532 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 UGT1A1P22309 533 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 UGT1A4P22310 534 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 UGT1A3P35503 534 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 UGT1A5P35504 534 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CDH12P55289 794 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 HTRA1Q92743 480 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 GPR88Q9GZN0 384 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MYL9P24844 172 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 RPS14P62263 151 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 HSPB3Q12988 150 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MADCAM1Q13477 382 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SCLYQ96I15 445 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MSRAQ9UJ68 235 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 NRP1O14786 923 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 HAT1O14929 419 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 DLX3O60479 287 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ACVRL1P37023 503 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SCNN1AP37088 669 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MAPK12P53778 367 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 LEMD2Q8NC56 503 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CASKO14936 926 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ASLP04424 464 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 NSG1P42857 185 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CASP9P55211 416 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ZBTB6Q15916 424 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 COQ7Q99807 217 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 EXD2Q9NVH0 621 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 FGF19O95750 216 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 PRNPP04156 253 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SNAPC1Q16533 368 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SLC9A6Q92581 669 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 ECI2O75521 394 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 IFNW1P05000 195 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CAPGP40121 348 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CYP2U1Q7Z449 544 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 GULP1Q9UBP9 304 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 H3BNX3 289 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 DNAJA2O60884 412 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 OR5F1O95221 314 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 CKMT2P17540 419 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-201ENST00000225983 SEPHS1P49903 392 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms