RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF555Q8NEP9 628 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T12Q8NG77 320 aa21.81■■□□□ 1.08
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.81■■□□□ 1.08
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM221A6NGB7 291 aa21.8■■□□□ 1.08
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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HTATSF1-201ENST00000218364 FIG4Q92562 907 aa21.79■■□□□ 1.08
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HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM14Q96QK8 99 aa21.78■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.78■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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HTATSF1-201ENST00000218364 ABRAXAS2Q15018 415 aa21.77■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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