RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF284Q2VY69 593 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 GK5Q6ZS86 529 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CEP250Q9BV73 2442 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CARNS1A5YM72 827 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 FGF19O95750 216 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 VIPR1P32241 457 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 STARD3Q14849 445 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PLD3Q8IV08 490 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 NPAS2Q99743 824 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 THTPAQ9BU02 230 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 DRC3Q9H069 523 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CDH19Q9H159 772 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SAR1AQ9NR31 198 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PQU0 124 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PYGLP06737 847 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RPIAP49247 311 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PKNOX1P55347 436 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SESN3P58005 492 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CLCQ05315 142 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 BNIP1Q12981 228 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 NAB1Q13506 487 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 E2F5Q15329 346 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CRY1Q16526 586 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 INSCQ1MX18 579 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SYVN1Q86TM6 617 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TEX37Q96LM6 180 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 C7orf26Q96N11 449 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 HHIPQ96QV1 700 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 DHRS7Q9Y394 339 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.46□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PQF6 199 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MATN2O00339 956 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PRAMEF4O60810 478 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CRCPO75575 148 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ESR1P03372 595 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CAPN1P07384 714 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ACP5P13686 325 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 GRIA2P42262 883 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 GAS6Q14393 721 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RNF43Q68DV7 783 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ERAP2Q6P179 960 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 GPR150Q8NGU9 434 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PATE1Q8WXA2 126 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SNX19Q92543 992 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 KCNJ9Q92806 393 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 GLYATL1Q969I3 302 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SKA1Q96BD8 255 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 XKR8Q9H6D3 395 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 WWOXQ9NZC7 414 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 AK5Q9Y6K8 562 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MGAQ8IWI9 3026 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 A0A087X1B8 175 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms