RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025421.7

Seh1l-201, Transcript of Nucleoporin SEH1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Seh1l, Length 3,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Seh1l-201ENSMUST00000025421 RtcAQ9D7H3 366 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rnf11Q9QYK7 154 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rrn3B2RS91 656 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm8334F7CD45 553 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Krt4P07744 525 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Vsx2Q61412 361 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mapk10Q61831 464 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Zbtb24Q80X44 710 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Msantd1Q8BIL2 278 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 1700020N01RikQ8CF20 87 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tspan11Q9D1D1 253 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ubqln5Q9D4I8 510 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Il23aQ9EQ14 196 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Capn10Q9ESK3 666 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cldn7Q9Z261 211 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm21885A0A286YDN8 145 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Vmn1r176G3UW31 304 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 PtnP63089 168 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Sema3dQ8BH34 777 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Plac9Q8K262 108 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cyp2j9Q924D1 502 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Efhc2Q9D485 750 aa16.1■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Grem1O70326 184 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dnmt3bO88509 859 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 P01644 108 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 P01645 108 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 P01646 108 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 P01647 108 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Chrm1P12657 460 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rbm15Q0VBL3 962 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Slc6a3Q61327 619 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Taf1cQ6PDZ2 836 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Olfr1037Q7TR84 321 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tmem202Q80W35 275 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ostm1Q8BGT0 338 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Anxa13Q99JG3 317 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 St7Q99M96 577 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 CatsperzQ9CQP8 194 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mcm8Q9CWV1 833 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fbxl20Q9CZV8 436 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Olfr1200A2ATJ4 336 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 M6prP24668 278 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gata6Q61169 589 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fam149b1Q6NSV7 578 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Trim14Q8BVW3 440 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mlc1Q8VHK5 382 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Q9D1F3 157 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Prmt1Q9JIF0 371 aa16.09■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Serpine3E9Q6A2 401 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cd247P24161 164 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 NcanP55066 1268 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pfdn6Q03958 127 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Hhla1Q3TYV2 514 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gpr141Q7TQP0 305 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 PisdQ8BSF4 406 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 ThtpaQ8JZL3 224 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Slc22a19Q8VCA0 551 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Asz1Q8VD46 475 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ptgr1Q91YR9 329 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Spg21Q9CQC8 308 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dmap1Q9JI44 468 aa16.08■□□□□ 0.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Apol11bE9PUZ0 337 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm3642K7N6V4 267 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Smpd2O70572 419 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fgf18O89101 207 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mapkapk2P49138 386 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pold1P52431 1105 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nipal2Q91WC7 383 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Agpat5Q9D1E8 365 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dusp26Q9D700 211 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Zfhx2Q2MHN3 2562 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm16494E9Q2Z4 87 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tnfaip1O70479 316 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 P01878 344 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dpf3P58269 378 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Sdf4Q61112 361 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Paqr3Q6TCG8 311 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tas2r131Q7M708 310 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Olfr1152Q7TR34 310 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Hs3st5Q8BSL4 346 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Lancl3Q8CD19 420 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Unc5aQ8K1S4 898 aa16.08■□□□□ 0.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Olfr690Q8VH18 315 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.4 ms