RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Creb5Q8K1L0 357 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr478Q8VG04 314 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VitQ8VHI5 650 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dach2Q925Q8 634 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnip2Q99JG7 430 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc4Q99PH1 652 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc12Q9CZA5 402 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr933Q9EQA0 308 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smpd3Q9JJY3 655 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acnat1A2AKK5 416 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13101A2ASJ0 481 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp952B0V2W4 504 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kbtbd6E9PYD7 486 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srp72F8VQC1 671 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kbtbd7G5E8C2 690 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21738J3QP72 227 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hs3st1O35310 311 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yap1P46938 488 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AnpepP97449 966 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PepdQ11136 493 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a23Q3UHH2 689 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf215Q5SPX3 379 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bfsp2Q6NVD9 416 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmcc2Q80W04 706 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb24Q80X44 710 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MmaaQ8C7H1 415 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtrf1Q8K126 446 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r205Q8R276 316 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco3a1Q8R3L5 710 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isoc1Q91V64 297 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4f13Q99N19 523 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AadatQ9WVM8 425 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10715J3QP74 227 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gp1baO35930 734 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cer1O55233 272 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WapP01173 134 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 JundP15066 341 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SagP20443 403 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agtr2P35374 363 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gli1P47806 1111 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sstr4P49660 385 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gucy2eP52785 1108 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw18Q3TSA9 469 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rabl6Q5U3K5 725 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MelkQ61846 643 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pwwp2aQ69Z61 730 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CapslQ6P8Y1 208 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd7Q8C8Y5 445 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Strip2Q8C9H6 844 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fem1cQ8CEF1 617 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golm1Q91XA2 393 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco1a5Q91YY5 670 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfsf13Q9D777 241 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KelQ9EQF2 713 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco1c1Q9ERB5 715 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6685D3YYP3 228 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arfip1G5E8V9 373 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smad6O35182 495 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gp6P0C191 313 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BdnfP21237 249 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VegfcP97953 415 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HexdcQ3U4H6 486 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1clQ3UXL1 322 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp22Q5DU02 525 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema4aQ62178 760 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Otop2Q80SX5 563 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd4bQ80XS6 687 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PolbQ8K409 335 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sirt3Q8R104 334 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DhddsQ99KU1 333 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10406A6NAS4 205 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3373A6NAS7 205 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3298E9PW80 205 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20431E9PY39 371 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3667K7N757 205 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01807 119 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh1P09803 884 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PlaaP27612 794 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptger3P30557 365 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UY34 256 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3558Q5FWC9 205 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glp2rQ5IXF8 512 aa12.48□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brsk1Q5RJI5 778 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.5 ms