RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A1W2PPW3 197 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ILVBLA1L0T0 632 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 E5RI56 91 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TLR5O60602 858 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CBFA2T3O75081 653 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ADAMTS4O75173 837 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 KATNA1O75449 491 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GMNNO75496 209 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CLDN11O75508 207 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 KCNH1O95259 989 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OTCP00480 354 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CAPN1P07384 714 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF12P17014 697 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC6A4P31645 630 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 FAM189BP81408 668 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SMARCB1Q12824 385 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 KIAA0040Q15053 153 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PLCL1Q15111 1095 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 FGD3Q5JSP0 725 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SVOPLQ8N434 492 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PJA1Q8NG27 643 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PPM1MQ96MI6 270 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF583Q96ND8 569 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 P2RY12Q9H244 342 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 HPS4Q9NQG7 708 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 USE1Q9NZ43 259 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF711Q9Y462 761 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ASB1Q9Y576 335 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.99□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MTMR11A4FU01 709 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OR7A17O14581 309 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OR1I1O60431 355 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MT-ND1P03886 318 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 F11P03951 625 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ASGR1P07306 291 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC10A3P09131 477 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 G6PDP11413 515 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 IMPDH2P12268 514 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CCNA2P20248 432 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GSTM2P28161 218 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC11A2P49281 568 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 KCNQ1P51787 676 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CLCN7P51798 805 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GABARAPL2P60520 117 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NFATC3Q12968 1075 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GPR17Q13304 367 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GTF2H2Q13888 395 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SELPLGQ14242 412 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NR6A1Q15406 480 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NEDD8Q15843 81 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CHST9Q7L1S5 443 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ACDQ96AP0 544 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ESAMQ96AP7 390 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.98□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms