RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TPGS2	Q68CL5	300 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPP	Q6IPU0	288 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD9	Q7L273	389 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA21	Q7Z572	469 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM160B2	Q86V87	743 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MFN1	Q8IWA4	741 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	UEVLD	Q8IX04	471 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM8	Q8N371	416 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SFRP1	Q8N474	314 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SETD9	Q8NE22	299 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	OCC1	Q8TAD7	63 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LPGAT1	Q92604	370 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB7B	Q96AH8	199 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MIB2	Q96AX9	1013 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf30	Q96GV9	206 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PKP2	Q99959	881 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACPT	Q9BZG2	426 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DPH5	Q9H2P9	285 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLK2	Q9NYY3	685 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	COPG2	Q9UBF2	871 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX7	Q9UNH6	387 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	STX8	Q9UNK0	236 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NSD2	O96028	1365 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0B4J203	849 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JPF8	293 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf100	A8MU93	164 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SGK1	O00141	431 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PRY	O14603	147 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	T	O15178	435 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN3	O15551	220 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GRID2	O43424	1007 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF5C	O60282	957 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO2B1	O94956	709 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT6B	P04259	564 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LINGO3	P0C6S8	592 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TPBGL	P0DKB5	382 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC192	P0DO97	292 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PDHB	P11177	359 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP9	P14780	707 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ST6GAL1	P15907	406 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	VCL	P18206	1134 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ITIH1	P19827	911 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB1	P25685	340 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CD27	P26842	260 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	POU1F1	P28069	291 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACADL	P28330	430 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP1	P28562	367 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX2	P48431	317 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT6C	P48668	564 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EFNA5	P52803	228 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GALC	P54803	685 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	F2RL1	P55085	397 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96

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