RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558341.5

PSMA4-206, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 5 BASIC

Gene PSMA4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-206	ENST00000558341	CUL4A	Q13619	759 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	KCNC3	Q14003	757 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341		A0A1W2PQ09	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341		H0YIN7	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	NDUFS4	O43181	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	TUBB	P07437	444 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	CSH1	P0DML2	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	CSH2	P0DML3	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	MMP9	P14780	707 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	PRLR	P16471	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	MSH3	P20585	1137 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC15A1	P46059	708 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	PRKG2	Q13237	762 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	AACS	Q86V21	672 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA4-206	ENST00000558341	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
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PSMA4-206	ENST00000558341	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CTDSP2	O14595	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	GJB3	O75712	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	NR2C2	P49116	596 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CIDEA	O60543	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	TSHB	P01222	138 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CBL	P22681	906 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CXCL9	Q07325	125 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	EPS8	Q12929	822 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	STPG4	Q8N801	248 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA4-206	ENST00000558341	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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