RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	DOK6	Q6PKX4	331 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	DPPA4	Q7L190	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PAK5	Q9P286	719 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	POLH	Q9Y253	713 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ESPN	B1AK53	854 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CCDC188	H7C350	402 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CTPS1	P17812	591 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NFKBIA	P25963	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FDFT1	P37268	417 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CCL11	P51671	97 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	EPHB1	P54762	984 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RAB15	P59190	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SH3BP2	P78314	561 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MC1R	Q01726	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GALNT3	Q14435	633 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	LIPI	Q6XZB0	460 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	USP45	Q70EL2	814 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	IPMK	Q8NFU5	416 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NCSTN	Q92542	709 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SMIM14	Q96QK8	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	LYSMD1	Q96S90	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	AP2A1	O95782	977 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GAS8	O95995	478 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	AGT	P01019	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	KRT14	P02533	472 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	HLA-DPA1	P20036	260 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	VIPR1	P32241	457 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TRIM23	P36406	574 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ADCY8	P40145	1251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PTGIR	P43119	386 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GPR3	P46089	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FOXM1	Q08050	763 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NFATC2	Q13469	925 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FICD	Q9BVA6	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PDZD2	O15018	2839 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PSMD3	O43242	534 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24

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