RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528066.1

RCOR3-209, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 3

Gene RCOR3, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-209	ENST00000528066	TSPAN1	O60635	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76	2e-6	■■■■■ 43.1
RCOR3-209	ENST00000528066	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	MTA2	O94776	668 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ERLIN2	O94905	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SEC24A	O95486	1093 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TOMM40	O96008	361 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PTPRB	P23467	1997 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ELF1	P32519	619 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SERPINF1	P36955	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TCHH	Q07283	1943 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TOMM20	Q15388	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CAMK4	Q16566	473 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PIM3	Q86V86	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	EME1	Q96AY2	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PTGES	O14684	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CHAD	O15335	359 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ASAP2	O43150	1006 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	B4GALT5	O43286	388 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	EDIL3	O43854	480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	AKAP3	O75969	853 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	NDUFB8	O95169	186 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ADCY5	O95622	1261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CMA1	P23946	247 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	AXL	P30530	894 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SFN	P31947	248 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CCKAR	P32238	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	KRT2	P35908	639 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SYK	P43405	635 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	GRIK3	Q13003	919 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	BRD3	Q15059	726 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TEAD2	Q15562	447 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCOR3-209	ENST00000528066	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76

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