RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PHF2	O75151	1096 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CSF2	P04141	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	IDS	P22304	550 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SEPHS1	P49903	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CLCNKA	P51800	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PFN3	P60673	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	MLC1	Q15049	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NR0B2	Q15466	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TNFSF14	O43557	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	AP2A1	O95782	977 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ARAF	P10398	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CEACAM1	P13688	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CKMT2	P17540	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	HADHA	P40939	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TAZ	Q16635	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ELMO1	Q92556	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CLPB	Q9H078	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846		E5RI56	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	YKT6	O15498	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	MPO	P05164	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	JMJD7	P0C870	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CHRM3	P20309	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ARSD	P51689	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CTSC	P53634	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PLTP	P55058	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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