RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FZD4Q9ULV1 537 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 YY2O15391 372 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TNFSF14O43557 240 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 RAMP2O60895 175 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SMC2O95347 1197 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ACSL1P33121 698 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FOLR3P41439 243 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 GCNT1Q02742 428 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CETN1Q12798 172 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 MTA1Q13330 715 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CHST9Q7L1S5 443 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FIBINQ8TAL6 211 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SKA1Q96BD8 255 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 BIRC7Q96CA5 298 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1B0GVT2 93 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC72A6NJI9 287 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM233B4DJY2 109 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TULP2O00295 520 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PSMA7O14818 248 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 VILLO15195 856 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 MPPED1O15442 326 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ACSL4O60488 711 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SLPIP03973 132 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 HLA-EP13747 358 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CD19P15391 556 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 NUDT1P36639 197 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PRCPP42785 496 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FMO5P49326 533 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CCR5P51681 352 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ST8SIA6P61647 398 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FOXI1Q12951 378 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 STIM1Q13586 685 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SLC12A1Q13621 1099 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PTPRRQ15256 657 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 KIF19Q2TAC6 998 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ICE2Q659A1 982 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM270Q6UE05 265 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 MFN1Q8IWA4 741 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 OR56A3Q8NH54 315 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 LMLNQ96KR4 655 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TIGD1Q96MW7 591 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 IL21RQ9HBE5 538 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TENM4Q6N022 2769 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 KNL1Q8NG31 2342 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PTPRBP23467 1997 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 A0A087WV48 116 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1B0GTQ1 180 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PPC4 97 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 M0QYV0 167 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SLC7A4O43246 635 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 LATO43561 262 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TBL1XO60907 577 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 MOCS3O95396 460 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 GNA14O95837 355 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 IGHV4-34P06331 123 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CD70P32970 193 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 HNF1BP35680 557 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ACADSBP45954 432 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 C21orf59P57076 290 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SULT2A1Q06520 285 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms