RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 CLN3Q13286 438 aa7.14□□□□□ -1.27
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SMIM20-202ENST00000514384 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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SMIM20-202ENST00000514384 FXNQ16595 210 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SV2CQ496J9 727 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 KRT80Q6KB66 452 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.13□□□□□ -1.27
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