RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMA3	P25788	255 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMB4	P28070	264 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-F	P30511	346 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	OR1E1	P30953	314 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	FDFT1	P37268	417 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	AVPR1A	P37288	418 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP5O	P48047	213 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	LMAN2	Q12907	356 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	GPS1	Q13098	491 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC12A1	Q13621	1099 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	ANGPT1	Q15389	498 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	PARP6	Q2NL67	630 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	ARMC3	Q5W041	872 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	STEAP4	Q687X5	459 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM215	Q68D42	235 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	KDELC1	Q6UW63	502 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	PCGF5	Q86SE9	256 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	DTX1	Q86Y01	620 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM25	Q86YD3	366 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	IQCK	Q8N0W5	287 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	BBOF1	Q8ND07	529 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	EXOC4	Q96A65	974 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRC45	Q96CN5	670 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC114	Q96M63	670 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SERPINB12	Q96P63	405 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	PSKH2	Q96QS6	385 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIB3	Q96RU7	358 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	KXD1	Q9BQD3	176 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SOX7	Q9BT81	388 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SERHL	Q9NQF3	203 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	LHX3	Q9UBR4	397 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717		Q9UFV3	132 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	CA14	Q9ULX7	337 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.49
DCTN1-222	ENST00000492717	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717		H0Y858	1186 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	AGPS	O00116	658 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ALOX15B	O15296	676 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TBL1X	O60907	577 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	IL18BP	O95998	194 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNB1	P01574	187 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ABHD2	P08910	425 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TSHR	P16473	764 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GLDC	P23378	1020 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GDI1	P31150	447 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CD70	P32970	193 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	THBS2	P35442	1172 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ADCY8	P40145	1251 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	VIPR2	P41587	438 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MAPK9	P45984	424 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RGR	P47804	291 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PLTP	P55058	493 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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