RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492170.1

MRPL55-231, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 5

Gene MRPL55, Length 241 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-231	ENST00000492170	DNASE1L3	Q13609	305 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	NFE2L1	Q14494	772 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	SPC24	Q8NBT2	197 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	CD180	Q99467	661 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	MAST4	O15021	2626 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	C21orf140	B9A014	251 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PRAMEF1	O95521	474 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ARL4D	P49703	201 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	GEM	P55040	296 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ACY1	Q03154	408 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	XRCC4	Q13426	336 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	SPA17	Q15506	151 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	KMT5C	Q86Y97	462 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	GBA3	Q9H227	469 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	LHX9	Q9NQ69	397 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PTPN13	Q12923	2485 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	CDC14C	A4D256	554 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	KLHL33	A6NCF5	533 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	OR5K3	A6NET4	321 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	MGAT4D	A6NG13	374 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	TLCD2	A6NGC4	264 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	C2orf81	A6NN90	581 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170		H7C0C1	242 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	CREG1	O75629	220 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	RFPL1	O75677	317 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ANXA9	O76027	345 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	TIAF1	O95411	115 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	RECK	O95980	971 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	APOC2	P02655	101 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FOLR1	P15328	257 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ATP5O	P48047	213 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	GSDMD	P57764	484 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FOXK1	P85037	733 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	KLRB1	Q12918	225 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	KCNAB1	Q14722	419 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	COLEC12	Q5KU26	742 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	CCDC181	Q5TID7	509 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	METRNL	Q641Q3	311 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	BBS12	Q6ZW61	710 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	DET1	Q7L5Y6	550 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	OOSP2	Q86WS3	158 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF398	Q8TD17	642 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	CT55	Q8WUE5	264 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	C12orf66	Q96MD2	445 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	MAP3K3	Q99759	626 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FICD	Q9BVA6	458 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ARL5A	Q9Y689	179 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PIPSL	A2A3N6	862 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	RCCD1	A6NED2	376 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FURIN	P09958	794 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	EBLN1	P0CF75	366 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	RBL1	P28749	1068 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	CA5A	P35218	305 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	MARCKSL1	P49006	195 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PMS2	P54278	862 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	OR2L2	Q8NH16	312 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	SEC14L1	Q92503	715 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	WWP1	Q9H0M0	922 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL55-231	ENST00000492170	FGF21	Q9NSA1	209 aa		14.98	□□□□□ -0.01

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