RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GABRA5P31644 462 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RBPJQ06330 500 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf88Q6PI97 169 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 DET1Q7L5Y6 550 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 BBS10Q8TAM1 723 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FAM81BQ96LP2 452 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 DPP3Q9NY33 737 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 YIPF1Q9Y548 306 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC188H7C350 402 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 HOXC8P31273 242 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 COG7P83436 770 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF3Q13114 568 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MYBPHQ13203 477 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RAB6CQ53S08 254 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MTERF3Q96E29 417 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SCMH1Q96GD3 660 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF778Q96MU6 729 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 WNT16Q9UBV4 365 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FLT1P17948 1338 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OR5K3A6NET4 321 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 XRCC3O43542 346 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 KDM4BO94953 1096 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 DANCRP0C864 163 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA4P34932 840 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 USP8P40818 1118 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A3P48764 834 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 LIMK1P53667 647 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G7Q13093 441 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF273Q14593 569 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 VWC2Q2TAL6 325 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 Q75L30 129 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF114Q8NC26 417 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PHF21BQ96EK2 531 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CDCA5Q96FF9 252 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PCYT2Q99447 389 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OLFM1Q99784 485 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 EVPLQ92817 2033 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 HEPACAM2A8MVW5 462 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 H0Y626 953 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 LDLRP01130 860 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CDK4P11802 303 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 NPY4RP50391 375 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PLIN5Q00G26 463 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 EGR4Q05215 589 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF234Q14588 700 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PELI3Q8N2H9 469 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RDM1Q8NG50 284 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PHF21AQ96BD5 680 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM19Q96HH6 336 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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