RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 TUBB3Q13509 450 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 UGT8Q16880 541 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.893e-14■■■■■ 49.8
NOP56-215ENST00000490753 TEX26Q8N6G2 289 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 Q8NA96 180 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TCTN2Q96GX1 697 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 OR2AG1Q9H205 316 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 KLC4Q9NSK0 619 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 POT1Q9NUX5 634 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CCDC188H7C350 402 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MAP2K7O14733 419 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MFSD11O43934 449 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LDLRP01130 860 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PTPN4P29074 926 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SERPINB6P35237 376 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PTGIRP43119 386 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GPR18Q14330 331 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 KCNAB1Q14722 419 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TERF2Q15554 542 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CHRNA6Q15825 494 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 INSCQ1MX18 579 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 IRGCQ6NXR0 463 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 EMBQ6PCB8 327 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SYVN1Q86TM6 617 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PRR7Q8TB68 274 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 THAP4Q8WY91 577 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SEC14L1Q92503 715 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 HSPH1Q92598 858 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MS4A14Q96JA4 679 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LYSMD1Q96S90 227 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 KRT12Q99456 494 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ING2Q9H160 280 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ACSS2Q9NR19 701 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.51□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 BRAFP15056 766 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FOLR1P15328 257 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TNFRSF8P28908 595 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PCK1P35558 622 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CCL11P51671 97 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PPP2R5EQ16537 467 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ALS2CLQ60I27 953 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC6A19Q695T7 634 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 IFT81Q8WYA0 676 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MAML1Q92585 1016 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZNF653Q96CK0 615 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GPR87Q9BY21 358 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MFRPQ9BY79 579 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PDE7BQ9NP56 450 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms