RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 GFI1Q99684 422 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MMP27Q9H306 513 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C5AR2Q9P296 337 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HACL1Q9UJ83 578 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MOSPD1Q9UJG1 213 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 VDAC3Q9Y277 283 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PP11 408 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LILRA5A6NI73 299 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 NDUFS4O43181 175 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB43O43298 467 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 T-ENOLP0DO92 83 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 VPREB1P12018 145 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 AMPHP49418 695 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CTSCP53634 463 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SIRPAP78324 504 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PPP2R2BQ00005 443 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KRT33BQ14525 404 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 E2F5Q15329 346 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C10orf53Q8N6V4 93 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KIF18AQ8NI77 898 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MED30Q96HR3 178 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ADGRG7Q96K78 797 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CCDC106Q9BWC9 280 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KCNK15Q9H427 330 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GAREM1Q9H706 876 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SELENONQ9NZV5 590 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 URADA6NGE7 173 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 C19orf81C9J6K1 198 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 J3QR06 171 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 MT-ND3P03897 115 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ERCC2P18074 760 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 HLA-DPA1P20036 260 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 NR2F2P24468 414 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 NMBRP28336 390 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CCKBRP32239 447 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 USP8P40818 1118 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PDLIM4P50479 330 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZNF131P52739 623 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZXDBP98169 803 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GAGE2BQ13066 116 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 UBE2V1Q13404 147 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SNTA1Q13424 505 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SLMAPQ14BN4 828 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GAGE2EQ4V326 116 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZNF534Q76KX8 674 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SLC38A5Q8WUX1 472 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 FIG4Q92562 907 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 FAM162AQ96A26 154 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CDCA5Q96FF9 252 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 BICD1Q96G01 975 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CCDC114Q96M63 670 aa4.83□□□□□ -1.64
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