RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MICU2Q8IYU8 434 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 RHOXF1Q8NHV9 184 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD49Q8WVL7 239 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PKMYT1Q99640 499 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TRIM54Q9BYV2 358 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PADI3Q9ULW8 664 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 U3KQV3 271 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CCDC154A6NI56 674 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SLC1A7O00341 560 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 IRAK2O43187 625 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 IGLV3-25P01717 112 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ODC1P11926 461 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 POU4F1Q01851 419 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ACAP2Q15057 778 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CST9Q5W186 159 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FIG4Q92562 907 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PPM1MQ96MI6 270 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 VAT1Q99536 393 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GLOD4Q9HC38 313 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 IL37Q9NZH6 218 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 KCNK2O95069 426 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CST1P01037 141 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 IMPDH1P20839 514 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 THPOP40225 353 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GPR15P49685 360 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CLK1P49759 484 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ATP4BP51164 291 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MAXP61244 160 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 STEAP3Q658P3 488 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SCD5Q86SK9 330 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GALNT13Q8IUC8 556 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LYSMD2Q8IV50 215 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TEX37Q96LM6 180 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FBXO8Q9NRD0 319 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 M0QX08 132 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 UBXN8O00124 270 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 AZIN1O14977 448 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SPNP16150 400 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ITIH1P19827 911 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TRIB2Q92519 343 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PROX1Q92786 737 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ACBD6Q9BR61 282 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TRIM39Q9HCM9 518 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ERVK-18Q9QC07 812 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PP18 115 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 UNCXA6NJT0 531 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CCRL2O00421 344 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CACNG3O60359 315 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 UPK1BO75841 260 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GABARAPO95166 117 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FTH1P02794 183 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FMO3P31513 532 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GRIK1P39086 918 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CASP3P42574 277 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 RACK1P63244 317 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 IHHQ14623 411 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PFKFB4Q16877 469 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 OVOS1Q6IE37 1185 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SPATC1Q76KD6 591 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TTC16Q8NEE8 873 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GPR152Q8TDT2 470 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SH3RF2Q8TEC5 729 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SPATA17Q96L03 361 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MRGPRX2Q96LB1 330 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PTPRDP23468 1912 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GJB3O75712 270 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FADS2O95864 444 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PAMP19021 973 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CCNCP24863 283 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 HRH2P25021 359 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CXCR2P25025 360 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CLK3P49761 638 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms