RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 RAXQ9Y2V3 346 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MLNP12872 115 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 HALP42357 657 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 LIMK2P53671 638 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CES3Q6UWW8 571 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PACS1Q6VY07 963 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MPP5Q8N3R9 675 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 HM13Q8TCT9 377 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.881e-15■■■■■ 133.4
ACTB-211ENST00000480301 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MFSD3Q96ES6 412 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 WWP1Q9H0M0 922 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SOX13Q9UN79 622 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PLD2O14939 933 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 DUX1O43812 170 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 OR1I1O60431 355 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 POLBP06746 335 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MPSTP25325 297 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PTK6Q13882 451 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R7Q15435 360 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PHF19Q5T6S3 580 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 OGFRQ9NZT2 677 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PDP2Q9P2J9 529 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 THRAP10827 490 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 HGFP14210 728 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ARNTP27540 789 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 GPR18Q14330 331 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ARMC3Q5W041 872 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 GPR150Q8NGU9 434 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 NCSTNQ92542 709 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB12Q96P63 405 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TTC1Q99614 292 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 COG4Q9H9E3 785 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RNF14Q9UBS8 474 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 AGRPO00253 132 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 QSOX1O00391 747 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 GSTM1P09488 218 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 IVDP26440 423 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PAFAH1B1P43034 410 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA3P43357 314 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MAPK9P45984 424 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 GSTM4Q03013 218 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 FGF11Q92914 225 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CCDC188H7C350 402 aa20.48■□□□□ 0.87
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