RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CPXCR1Q8N123 301 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PQLC3Q8N755 202 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RXFP2Q8WXD0 754 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM143Q96AN5 459 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ASB9Q96DX5 294 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SGF29Q96ES7 293 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MPP4Q96JB8 637 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 VPS50Q96JG6 964 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 Q96MF0 132 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PEBP4Q96S96 227 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SORT1Q99523 831 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 VAT1Q99536 393 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RBBP8Q99708 897 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 EBF4Q9BQW3 602 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TCHPQ9BT92 498 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MECRQ9BV79 373 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 APOL6Q9BWW8 343 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUF2Q9BZD4 464 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 IL22Q9GZX6 179 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MUC13Q9H3R2 512 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 LANCL2Q9NS86 450 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 EMCNQ9ULC0 261 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDYLQ9Y232 598 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 LZTS1Q9Y250 596 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 DERAQ9Y315 318 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 INSL6Q9Y581 213 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 COX11Q9Y6N1 276 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MGAMO43451 1857 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIP11Q15643 1979 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A087WXM4 84 aa3.53□□□□□ -1.84
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RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTC36A6NLP5 189 aa3.53□□□□□ -1.84
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RNU6-55P-201ENST00000411092 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MEI4A8MW99 385 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 E9PBE3 544 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM38O00635 465 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCXO43602 365 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 BRINP1O60477 761 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 AVILO75366 819 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CABYRO75952 493 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDE5AO76074 875 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRSS23O95084 383 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 H6PDO95479 791 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TFAP2AP05549 437 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYL3P08590 195 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MMP10P09238 476 aa3.53□□□□□ -1.84
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