RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 OR2AG1Q9H205 316 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 CD248Q9HCU0 757 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SCML1Q9UN30 329 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 CDK14O94921 469 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 UBOX5O94941 541 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TSPAN8P19075 237 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 HK2P52789 917 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 CCINQ13939 588 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 CUZD1Q86UP6 607 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PLA2G15Q8NCC3 412 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ZFP69BQ9UJL9 534 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 OARD1Q9Y530 152 aa28.94■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 DIAPH2O60879 1101 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 GBX1Q14549 363 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SYTL3Q4VX76 610 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 FBXO48Q5FWF7 155 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ANKS6Q68DC2 871 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 DEFB123Q8N688 67 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 HIC2Q96JB3 615 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 COG4Q9H9E3 785 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SLCO1B7G3V0H7 640 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 MAN2B1O00754 1011 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ZNF195O14628 629 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 NUAK1O60285 661 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ACADMP11310 421 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 AGTR2P50052 363 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 IDH3AP50213 366 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 CDH13P55290 713 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 RPS21P63220 83 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PPP1R3AQ16821 1122 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 WSCD2Q2TBF2 565 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PNCKQ6P2M8 343 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ASZ1Q8WWH4 475 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 KLK6Q92876 244 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 FAM131CQ96AQ9 280 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SKA1Q96BD8 255 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 CCM2Q9BSQ5 444 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 OSBPL6Q9BZF3 934 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TRIM39Q9HCM9 518 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 MMP17Q9ULZ9 603 aa28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 FFAR2O15552 330 aa28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 MPC1LP0DKB6 136 aa28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TMEM92Q6UXU6 159 aa28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 VTI1BQ9UEU0 232 aa28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 FIS1Q9Y3D6 152 aa28.92■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD65E5RJM6 399 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 MATN2O00339 956 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 HDAC3O15379 428 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 RPS17P08708 135 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ADPRHP54922 357 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SGCGQ13326 291 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 FAM124AQ86V42 546 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 HEATR4Q86WZ0 1026 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 VRK3Q8IV63 474 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 MRGPRX1Q96LB2 322 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ASB2Q96Q27 587 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 EGFL8Q99944 293 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 EPHX3Q9H6B9 360 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ATXN10Q9UBB4 475 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 CA14Q9ULX7 337 aa28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 A0A1W2PQU0 124 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 GUCA1CO95843 209 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 VCLP18206 1134 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PHKG1Q16816 387 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 BCL7AQ4VC05 210 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 FZD4Q9ULV1 537 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 DUSP12Q9UNI6 340 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TRPM6Q9BX84 2022 aa28.9■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TMEM202A6NGA9 273 aa28.89■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 TMEM233B4DJY2 109 aa28.89■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 LOC730098B7Z3J9 87 aa28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms