RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383331.4

HCG27-201, Transcript of HLA complex group 27, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HCG27, Length 1,720 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG27-201ENST00000383331 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PCTPQ9UKL6 214 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 TM7SF2O76062 418 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 TRIM16O95361 564 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 THRAP10827 490 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ITGB6P18564 788 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 DGKAP23743 735 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ITGB7P26010 798 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 AGTR2P50052 363 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 HERC3Q15034 1050 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CRY1Q16526 586 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 DPPA4Q7L190 304 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ZBTB2Q8N680 514 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 RTKNQ9BST9 563 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 MRGBPQ9NV56 204 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SMOXQ9NWM0 555 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 MEI4A8MW99 385 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 AZIN1O14977 448 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SNX2O60749 519 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PEX11AO75192 247 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 KRT34O76011 436 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CCND1P24385 295 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 MXRA7P84157 204 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 RALGDSQ12967 914 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 KANK2Q63ZY3 851 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ERAP2Q6P179 960 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ZNF366Q8N895 744 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 EDAQ92838 391 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CD274Q9NZQ7 290 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.68□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CKAP5Q14008 2032 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 H0Y858 1186 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PSMD11O00231 422 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CHUKO15111 745 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 MLYCDO95822 493 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CD1EP15812 388 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 IL12RB1P42701 662 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SLC25A3Q00325 362 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ELP6Q0PNE2 266 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PDPRQ8NCN5 879 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 C19orf60Q96EN9 201 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PANX3Q96QZ0 392 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 FAM129BQ96TA1 746 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 THTPAQ9BU02 230 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 OARD1Q9Y530 152 aa14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 E2F3O00716 465 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CBSLP0DN79 551 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 HLA-EP13747 358 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 ITGAXP20702 1163 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 CBSP35520 551 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 MMP12P39900 470 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 GALK1P51570 392 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 FOXA1P55317 472 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SNX32Q86XE0 403 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 DNASE1L2Q92874 299 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 MARK4Q96L34 752 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 C3orf30Q96M34 536 aa14.66□□□□□ -0.06
HCG27-201ENST00000383331 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms