RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 SCAMP1O15126 338 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 DMPKQ09013 629 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TMED2Q15363 201 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 CEP85LQ5SZL2 805 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ACVR1CQ8NER5 493 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 FAM136AQ96C01 138 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 OLFM1Q99784 485 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 VIPAS39Q9H9C1 493 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KLC4Q9NSK0 619 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SPASTQ9UBP0 616 aa27.3■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 SLC23A2Q9UGH3 650 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 HMX2A2RU54 273 aa27.29■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF423Q2M1K9 1284 aa27.29■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TTLL9Q3SXZ7 439 aa27.29■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 ASZ1Q8WWH4 475 aa27.29■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa27.29■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 TRIM49D1C9J1S8 452 aa27.28■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 CER1O95813 267 aa27.28■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINB8P50452 374 aa27.28■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TAS2R39P59534 338 aa27.28■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa27.28■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 CAB39LQ9H9S4 337 aa27.28■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 FAM8A1Q9UBU6 413 aa27.28■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 PCDH15Q96QU1 1955 aa27.28■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM131Q92545 1883 aa27.28■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 IRX4P78413 519 aa27.27■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM159Q96B96 161 aa27.27■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 NCDNQ9UBB6 729 aa27.27■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 PIM3Q86V86 326 aa27.27■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa27.27■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 SMOC1Q9H4F8 434 aa27.27■■□□□ 1.96
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GIPC1-201ENST00000345425 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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GIPC1-201ENST00000345425 ISL2Q96A47 359 aa27.26■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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GIPC1-201ENST00000345425 PIAS2O75928 621 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 KRT15P19012 456 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 ACTR1BP42025 376 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 ACTR1AP61163 376 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 TIFABQ6ZNK6 161 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 RAPH1Q70E73 1250 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC91Q7Z6B0 441 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 GIMAP7Q8NHV1 300 aa27.25■■□□□ 1.95
GIPC1-201ENST00000345425 SYTL2Q9HCH5 934 aa27.25■■□□□ 1.95
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