RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SRRDQ9UH36 339 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EBF1Q9UH73 591 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SBF1O95248 1867 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ISPDA4D126 451 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GLTPD2A6NH11 291 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EFSO43281 561 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CST8O60676 142 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TNNC2P02585 160 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RFC2P35250 354 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACOT2P49753 483 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GALCP54803 685 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACTR1AP61163 376 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ERVK-9P63128 1117 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BNC1Q01954 994 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TNFAIP2Q03169 654 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PUDPQ08623 228 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BNIP2Q12982 314 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GRIK2Q13002 908 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 STARD3Q14849 445 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CA9Q16790 459 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZBED5Q49AG3 693 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL12Q53G59 568 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AFMIDQ63HM1 303 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CGB2Q6NT52 195 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SNX20Q7Z614 316 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GPAT4Q86UL3 456 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KRT78Q8N1N4 520 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 METTL13Q8N6R0 699 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OR8J2Q8NGG1 315 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SGTBQ96EQ0 304 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MS4A14Q96JA4 679 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MYRFLQ96LU7 910 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KCNJ15Q99712 375 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TXN2Q99757 166 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HMG20AQ9NP66 347 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TREM1Q9NP99 234 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RAB20Q9NX57 234 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CTSFQ9UBX1 484 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BTNL2Q9UIR0 455 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACSL5Q9ULC5 683 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AP4S1Q9Y587 144 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DOCK5Q9H7D0 1870 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 H3BRB1 525 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PITPNM1O00562 1244 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CYP26A1O43174 497 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 HUS1O60921 280 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GCATO75600 419 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 STBD1O95210 358 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PGLSO95336 258 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 IFNA4P05014 189 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CKMT2P17540 419 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GLRA2P23416 452 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 EDNRBP24530 442 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ECHS1P30084 290 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SLC1A3P43003 542 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 YAP1P46937 504 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ALDH3A2P51648 485 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GDF10P55107 478 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PSPHP78330 225 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DYRK1AQ13627 763 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TTLL4Q14679 1199 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CHRNA6Q15825 494 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL26Q53HC5 615 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ATAD3CQ5T2N8 411 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MLIPQ5VWP3 458 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ELP2Q6IA86 826 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FDX2Q6P4F2 183 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SV2AQ7L0J3 742 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 RETREG3Q86VR2 466 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms