RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 TAPBPO15533 448 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00032P0C843 101 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 YAF2Q8IY57 180 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CDK15Q96Q40 435 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 FAM129BQ96TA1 746 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 AOAHP28039 575 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 IL12RB1P42701 662 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF284Q2VY69 593 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PARM1Q6UWI2 310 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SNX31Q8N9S9 440 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TMIEQ8NEW7 156 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 FGF14Q92915 247 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 HCN2Q9UL51 889 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CBSLP0DN79 551 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CCND1P24385 295 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ITGB7P26010 798 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CBSP35520 551 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA7P48741 367 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT2P50583 147 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CRY1Q16526 586 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ACOX2Q99424 681 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 EGFL8Q99944 293 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SGTAO43765 313 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 OR4F21O95013 312 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PSMC3P17980 439 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 VCLP18206 1134 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SQLEQ14534 574 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GK5Q6ZS86 529 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 VRK3Q8IV63 474 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 AP2M1Q96CW1 435 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 RCN3Q96D15 328 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 RAD18Q9NS91 495 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC1BQ9P126 229 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 MSH3P20585 1137 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ERVPABLB-1P60509 514 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 HERC3Q15034 1050 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF382Q96SR6 550 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 POLG2Q9UHN1 485 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PLXNA2O75051 1894 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 MYO9BQ13459 2157 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 OR2AG2A6NM03 316 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP99D6REC4 459 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 WNT9AO14904 365 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GIPC1O14908 333 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CHUKO15111 745 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 UROSP10746 265 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GDF5P43026 501 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CREB5Q02930 508 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2H2Q13888 395 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GRB7Q14451 532 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TIFAQ96CG3 184 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.36■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 H0Y3Z8 333 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 OR7A17O14581 309 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 KAT7O95251 611 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GDI1P31150 447 aa22.35■■□□□ 1.17
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