RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 CHN2P52757 468 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC66Q68CR7 880 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 IL27RAQ6UWB1 636 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TPRG1Q6ZUI0 275 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 GPR26Q8NDV2 337 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 LRTOMTQ8WZ04 291 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ZUFSPQ96AP4 578 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 VOPP1Q96AW1 172 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 VPS33AQ96AX1 596 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ECHDC3Q96DC8 303 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM45AQ9NWC5 275 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CMTM6Q9NX76 183 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SUN2Q9UH99 717 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 AP4B1Q9Y6B7 739 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC154A6NI56 674 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF839A8K0R7 811 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 GRIA3P42263 894 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 HSPA7P48741 367 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TRAF3Q13114 568 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SPATS1Q496A3 300 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 UGT2A3Q6UWM9 527 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 Q6ZSR9 355 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ARPINQ7Z6K5 226 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 EME1Q96AY2 570 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ASIC4Q96FT7 647 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SCRN2Q96FV2 425 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 EGFL8Q99944 293 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 IPPKQ9H8X2 491 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SLC25A13Q9UJS0 675 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SEMG2Q02383 582 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TTLL9Q3SXZ7 439 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 GBP5Q96PP8 586 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SUV39H2Q9H5I1 410 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SUFUQ9UMX1 484 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CCL26Q9Y258 94 aa23.59■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 FAM234BA2RU67 622 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 AGAP14A8MT82 685 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 GRM6O15303 877 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TAPBPO15533 448 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 PHKG1Q16816 387 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SFRP1Q8N474 314 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM199Q8N511 208 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 WWOXQ9NZC7 414 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SNX13Q9Y5W8 968 aa23.58■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 MAP3K13O43283 966 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 KATNA1O75449 491 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 CSPG5O95196 566 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 LINC00271P0C7V0 271 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 HMOX2P30519 316 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 CCR2P41597 374 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 NSG1P42857 185 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 TIGD2Q4W5G0 525 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 UBTD2Q8WUN7 234 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM79Q9BSE2 394 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 FAM192AQ9GZU8 254 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 AQP12BA6NM10 295 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 NR6A1Q15406 480 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 CRY1Q16526 586 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 SULT1C3Q6IMI6 304 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 LCN8Q6JVE9 175 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 MILR1Q7Z6M3 343 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 AQP12AQ8IXF9 295 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM125Q96AQ2 219 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 OPTCQ9UBM4 332 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 AP1G1O43747 822 aa23.56■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 PAGE3Q5JUK9 113 aa23.56■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 FOXB2Q5VYV0 432 aa23.56■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.56■■□□□ 1.36
TRIM54-201ENST00000296098 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms