RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264414.8

CUL3-201, Transcript of cullin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUL3, Length 6,741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-201ENST00000264414 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 NOBOXO60393 691 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 PER3P56645 1201 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 MLIPQ5VWP3 458 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 LIPMQ5VYY2 423 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 CIB1Q99828 191 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 CPNE6O95741 557 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 DGKEP52429 567 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 COX18Q8N8Q8 333 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 ITGA5P08648 1049 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 HSPA7P48741 367 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 OR12D2P58182 307 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 LGR4Q9BXB1 951 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 UCK2Q9BZX2 261 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 HSPA12AO43301 675 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 IDSP22304 550 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 ACSL1P33121 698 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 CD47Q08722 323 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 XKRXQ6PP77 449 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 VITQ6UXI7 678 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 HSDL2Q6YN16 418 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 NXPE2Q96DL1 559 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 APOC2P02655 101 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 TEAD4Q15561 434 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 MREGQ8N565 214 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 OR2T12Q8NG77 320 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 HERVK_113Q902F9 699 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 APBB2Q92870 758 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 NCDNQ9UBB6 729 aa14.65□□□□□ -0.06
CUL3-201ENST00000264414 IL7RP16871 459 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 TCF12Q99081 682 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 RMI1Q9H9A7 625 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 CEP152O94986 1710 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 C9IYK1 514 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 SLC30A4O14863 429 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 TGFB3P10600 412 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 ELNP15502 786 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 GJA9P57773 515 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 KCNJ2P63252 427 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 UBXN11Q5T124 520 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 GLYATQ6IB77 296 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 KCTD9Q7L273 389 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 PDCD5O14737 125 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 ENTPD1P49961 510 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 CCINQ13939 588 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 USP30Q70CQ3 517 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 ZNF410Q86VK4 478 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 SMIM30A4D0T7 59 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 BTBD19C9JJ37 291 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 NUAK1O60285 661 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 GADD45AP24522 165 aa14.64□□□□□ -0.07
CUL3-201ENST00000264414 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms