RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 FIBCD1Q8N539 461 aa16.08■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.08■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.08■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 HALP42357 657 aa16.07■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 PLD3Q8IV08 490 aa16.06■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 ZBTB2Q8N680 514 aa16.06■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 COX4I2Q96KJ9 171 aa16.06■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.06■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 SEC22BO75396 215 aa16.06■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 MYO1DO94832 1006 aa16.06■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 SLC7A1P30825 629 aa16.06■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 ST8SIA6P61647 398 aa16.06■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.06■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 IGHA2P01877 340 aa16.06■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 AKR1D1P51857 326 aa16.06■□□□□ 0.16
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CTCF-201ENST00000264010 GTF2H2Q13888 395 aa16.06■□□□□ 0.16
CTCF-201ENST00000264010 IL23RQ5VWK5 629 aa16.06■□□□□ 0.16
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