RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGB4Q8WW32 186 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R36Q96LQ0 422 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NPAS2Q99743 824 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MEAF6Q9HAF1 191 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 R4GN57 208 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GON4LQ3T8J9 2241 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BNH8 94 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CD160O95971 181 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 AHSGP02765 367 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CD1EP15812 388 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A2P31639 672 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCG1P45844 678 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP4BP51164 291 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NUBP1P53384 320 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 INHBCP55103 352 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 OXCT1P55809 520 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 POU4F1Q01851 419 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMD1Q8N878 549 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A23Q9BV35 468 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A8Q9C0K1 460 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGB4Q9UN71 923 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA7Q8IZY2 2146 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DYTNA2CJ06 578 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA9O76027 345 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP10O95393 424 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRG2P18507 467 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PAMP19021 973 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKEP52429 567 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB17Q13105 803 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBPC3Q14896 1274 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF4L2Q8NA75 395 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GAB3Q8WWW8 586 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD60Q9BZ19 345 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf4Q9NR00 106 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 INVSQ9Y283 1065 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GLRBP48167 497 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT2A1Q06520 285 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GK3PQ14409 553 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNYL1Q8N7R7 359 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKFN1Q8N957 763 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLM1Q8NBJ4 401 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1E2Q96A05 226 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 COQ10BQ9H8M1 238 aa25.98■■□□□ 1.75
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CAPNS1-201ENST00000246533 VPS45Q9NRW7 570 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF11Q9Y3C5 154 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SRCP12931 536 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0408Q6ZU52 694 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 AMIGO2Q86SJ2 522 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF148Q8N7C7 305 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NELL1Q92832 810 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEH1Q9H213 219 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CD300AQ9UGN4 299 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 UBDO15205 165 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFV2P19404 249 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR7P34969 479 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR10P46092 362 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ACADVLP49748 655 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ST8SIA6P61647 398 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NUMA1Q14980 2115 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF783Q6ZMS7 281 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF354CQ86Y25 554 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMOQ9BU70 441 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC1Q9NVT9 282 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BSA7 217 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PFDN1O60925 122 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 APBB3O95704 486 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 JUNP05412 331 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PYGLP06737 847 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP2P12643 396 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRB3P28472 473 aa25.96■■□□□ 1.75
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