RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klhl41A2AUC9 606 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1188A2AV10 312 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MipepA6H611 711 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apol11bE9PUZ0 337 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r8L7N472 848 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eno3P21550 434 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp868Q3UTQ6 422 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Defb48Q3UW22 87 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dlx3Q64205 287 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gga2Q6P5E6 603 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr845Q7TRG2 312 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf775Q8BI73 538 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdh7Q8BM92 785 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nat14Q8BVG8 206 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc5a11Q8K0E3 673 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcdhb21Q91V48 774 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q9CWU4 180 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chrac1Q9JKP8 129 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acsl4Q9QUJ7 711 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PnckQ9QYK9 343 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm2897K7N6T7 172 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kpna3O35344 521 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pdha2P35487 391 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dusp2Q05922 318 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbccd1Q640P7 552 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abhd10Q6PE15 297 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr664Q7TRP5 306 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Efemp1Q8BPB5 493 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klhl2Q8JZP3 593 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lgals12Q91VD1 314 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mta3Q924K8 591 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MpstQ99J99 297 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc4Q99PH1 652 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PodxlQ9R0M4 503 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 B4galt6Q9WVK5 382 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm11983V9GXS8 105 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adam34A2RSG8 714 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Saxo1B1AXP3 476 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp4f17G3UW78 524 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ap1g2O88512 791 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gabrg2P22723 474 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rsrp1Q3UC65 298 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam196aQ3USH1 422 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Akr1clQ3UXL1 322 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcna5Q61762 602 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tshz2Q68FE9 1030 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ChiaQ91XA9 473 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Creld1Q91XD7 420 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp4f16Q99N17 524 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PinlypQ9CQD7 212 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rgs19Q9CX84 216 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Jph2Q9ET78 696 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itgb1bp2Q9R000 350 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Capn7Q9R1S8 813 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 UprtB1AVZ0 310 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r65G3X931 845 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 JunP05627 334 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gucy2eP52785 1108 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Perm1Q149B8 807 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 OtulinQ3UCV8 352 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Glb1l2Q3UPY5 636 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cage1Q5IR70 849 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam149b1Q6NSV7 578 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Det1Q9D0A0 550 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Creb3l4Q9D2A5 370 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dtwd1Q9D8U7 304 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ern2Q9Z2E3 911 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mtx3D3YTP3 312 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nccrp1G3X9C2 266 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itpripl2Q3UV16 535 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Npsr1Q8BZP8 371 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r71Q8VIC0 307 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf31Q924T7 1066 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tor1bQ9ER41 336 aa28.33■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Auts2A0A087WPF7 1261 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scg5P12961 212 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abce1P61222 599 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adra1bP97717 514 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr174Q3U507 335 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TsnQ62348 228 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 C1raQ8CG16 707 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1311Q8VET0 312 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr806Q8VFI2 313 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr459Q924H8 314 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psmd12Q9D8W5 456 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.3 ms