RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slco1a4Q9EP96 670 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Simc1E9Q6E9 1354 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyp4a32A2A8T1 509 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dusp8O09112 663 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ChkaO54804 453 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kir3dl1P83555 432 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mgat3Q10470 538 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kcnv1Q8BZN2 503 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q8CDN1 933 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cuedc1Q8R3V6 388 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pcdha8Q91Y12 946 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TympQ99N42 471 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MutyhQ99P21 515 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TrmuQ9DAT5 417 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tor1bQ9ER41 336 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab25Q9WTL2 213 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Coro1cQ9WUM4 474 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ripor3A1L3T7 938 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GabreA2AMW3 916 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab11fip2G3XA57 512 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r51L7N215 852 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Polr3bP59470 1133 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pcdh19Q80TF3 1145 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cul9Q80TT8 1865 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wdr26Q8C6G8 641 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Uba7Q9DBK7 977 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hspb3Q9QZ57 154 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nhsl2B1AXH1 854 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Adh6aE9Q5Z6 375 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bhlhe40O35185 411 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 FxnO35943 207 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Snrpd2P62317 118 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 RubcnlQ3TD16 648 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndst1Q3UHN9 882 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 HrQ61645 1182 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1037Q7TR84 321 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdkl3Q8BLF2 595 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gen1Q8BMI4 908 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lrrc4Q99PH1 652 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wnt8bQ9WUD6 350 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ap1m2Q9WVP1 423 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kcnq2Q9Z351 759 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mknk1O08605 427 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Brd7O88665 651 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Spp1P10923 294 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 M6prP24668 278 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 WarsP32921 481 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stat5aP42230 793 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Adam6bQ6IMH7 756 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lix1Q6P566 282 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem114Q9D563 222 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Casz1Q9CWL2 1761 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tarbp1E9Q368 1579 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r70K7N702 854 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aldh1a7O35945 501 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aldh1a1P24549 501 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dennd1bQ3U1T9 766 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gal3st4Q3V1B8 480 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 C6.1alQ7M757 291 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AptxQ7TQC5 342 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1106Q7TR57 312 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp62Q8C827 914 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Klhl36Q8R124 613 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr695Q8VFM3 315 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nt5c1bQ91YE9 573 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ints12Q9D168 461 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nmrk2Q9D7C9 195 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sppl2aQ9JJF9 523 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gria3Q9Z2W9 888 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kat6aQ8BZ21 2003 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttll11A4Q9F4 727 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ItpkbB2RXC2 942 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sap18O55128 153 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SmoP56726 793 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1313Q7TQW8 311 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q8BGK9 164 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem161bQ8C2L6 487 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr809Q8VEX8 328 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Asf1aQ9CQE6 204 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GmfbQ9CQI3 142 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab27aQ9ERI2 221 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trim2Q9ESN6 744 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Orc5Q9WUV0 435 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm21885A0A286YDN8 145 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Chrna10B2RX82 447 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm8127E9Q0P0 100 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nrp2O35375 931 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Anxa2P07356 339 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms